辩证唯物主义是我们分析事物的基本方法，是从事任何研究都不可或缺的科学的方法论。在科学研究中，是全面地、联系地、发展地看问题，还是片面地、孤立地、静止地看问题，是把事物内部的矛盾运动看做导致事物发展变化的根本原因，还是把外力的推动作为事物变化的根本原因，是区分辩证唯物论和形而上学的重要分水岭。马克思主义辩证唯物论认为，世界上一切事物都是相互联系、不断运动和发展变化的。导致事物发展变化的，既有内因，也有外因。内因是事物内部的矛盾运动，是导致事物发展变化的第一位的原因；外因是一事物与它事物之间的联系和影响，是第二位的原因，外因通过内因而起作用。因此，要从分析事物内部的矛盾运动以及一事物与他事物的关系去研究事物的发展变化。研究事物，要避免主观性、片面性，要透过现象看本质。这一原理适用于一切科学研究，考古学也不例外。例如，作为考古学研究基本对象的考古学文化是在一定的时间和空间范围内，具有一组特征的文化遗存，它往往是一个人群生活所遗留下来的物质遗存。我们可以通过对这个考古学文化的研究来分析该人群的物质生活、精神生活和社会生活，诸如衣食住行、婚丧嫁娶、与周围的其他人群之间的关系等。在进行考古学文化研究的时候，是以联系的观点、运动的观点和发展变化的观点来进行分析，还是孤立地、静止地看问题，是只注意到现象，透物见物，还是在对遗物对各种现象进行缜密观察和研究的基础上，透过现象看本质，透过遗迹和遗物，分析其背后的当时人们的意识、观念和当时的自然和社会的背景，往往会得出完全不同的结论。分析考古学文化的变化和一个集团的兴衰变化的时候，是从内因和外因两方面来分析，即从该考古学文化和社会的内部结构与外部条件两方面来进行分析，还是仅仅考虑外部因素或外来的影响，也会得出完全不同的结论。例如，研究文明起源和国家形成的原因时，是仅仅强调环境变化的作用，还是既考虑环境的变化或外来文化的影响，同时更注重从社会内部的发展变化来考虑，会得出完全不同的结论。前者往往会落入“环境决定论”的窠臼，将自然环境的变化作为社会变化的决定性的原因，后者则在考虑环境变化的同时，考虑这种变化对人们的社会组织和结构带来的影响，即坚持了内因和外因的综合考虑。
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      还有，在研究文化和社会的发展变化的时候，辩证唯物主义的量变质变规律也是可以很好地应用的。例如，文明的起源和形成，就是文明因素从量的积累到质的变化的过程。文明和国家不是某一天突然诞生的，是一个缓慢的变化过程。总量变中有部分质变，社会结构由简单变得日益复杂，由平等的社会逐渐变为不平等的阶层的社会，最终变为阶级社会。进入文明社会之后，社会又在不断的发展变化，即在质变之后又开始新的量变。认识到量变质变规律，并能够在研究中正确地运用，就会很自然地把文明起源、形成和发展当作一个连续发展的过程，就可以避免把文明出现之前和之后的社会相割裂。片面地强调某一事件（如禹传子）对于文明形成的决定作用，就会忽视了对文明社会的形成和发展过程及其背景、过程和动力的全面考察。